一般说来，果蔬采收后，经过挑选，分级、包装尚未发病的果实，在运输和贮藏过程中发生的一类病害，称为果蔬贮运病害。贮运病害的果实病害的重要组成部分，随着对果蔬贮运病害的深入探讨，不少果实病害亦纳入到贮运中去。
    果蔬贮运病害按其有病原微生物又分为两大类：侵染性病害（亦称微生物病害）和非侵染性病害（亦称生理性病害）。
    果蔬贮运病害按其在果蔬贮藏中危害的时间，又分为前期贮藏病害、中后期贮藏病害，运输期病害的货架期病害。
    果蔬贮运病害按其对温度的适应范围，分为常温（含亚常温）贮运病害和低温贮运病害。
    果蔬贮运病害按其对果蔬种类危害的不同，分为苹果、梨、葡萄、桃、杏、李、樱桃、山楂、柑橘、荔枝、龙眼、芒果、菠萝、猕猴桃、西瓜、甜瓜、菜豆、大白菜、萝卜、马铃薯等贮运病害。
    此外，在侵染性病害中，视其病原菌的种类不同，又分为真菌病害和细菌病害。
在生理病害中:
1.因贮藏环境中温度过低（但未达到果蔬的冰点）时不能忍受这种低温而代谢失调，发生的病害（冷害）；
2.果实生长期缺乏某些元素（如缺Ca或Mg），在采收贮运期引起的一类病害（缺素症）；
3.在气调贮藏过程因过低O2和过高的CO2产生的伤害(低氧伤害与二氧化碳中毒)；
4.在防腐过程中，因使用药剂量过高而引起的病害；
5.在贮运过程中过高的温度和湿度，促使其衰老引起的病害；
6.果实贮运过程中，由于果实自身新陈代谢产生的一些有害物质刺激果皮、果肉而产生的病变果等。
    在一些果蔬贮运侵染性病害中，病原菌的侵入时期多发生在果实的生长期，但不表现症状，长期潜伏，待果实成熟和贮运期致病危害。这种病害的潜伏期，因其贮藏环境不同和果实衰老程度的差异而有长有短。因此，有人认为这类病害属果实病害，但多数人认为是果蔬贮藏病害。